2012年全国中医药工作会议当天在北京召开。陈竺在会上说，在深化医改中进一步发挥好中医药作用。三年医改重点任务即将完成，“十二五”医改工作启动在即，医改将推向深入。必须明确，中央确定的在医改中坚持中西医并重的方针，发挥中医药作用的原则，必须毫不动摇的坚持下去，而且要花更大的力气、采取更多的措施，把中医药的资源进一步利用好，把中医药的作用进一步发挥好。
陈竺说，医改3年来，各地结合当地实际，进行了有益的探索，取得了很好的效果，如安徽、广西将扶持中医药发展作为医改的重点任务之一，特别是甘肃省充分利用中医药特色优势和资源优势，鼓励中医药服务的提供与利用，发挥中医药在基本公共卫生服务和基本医疗中的作用，探索了一条符合省情、惠及群众的路子。
“实践证明，在医改中发挥中医药作用，有利于促进医改目标的实现，有利于促进基本医疗卫生制度的构建。”陈竺说。
据了解，中医药在经济社会发展中的地位得到进一步提升，国家“十二五”规划纲要中，将支持中医药发展作为单节列出，成为“完善基本医疗卫生制度”六项重点任务之一，同时在“优化对外贸易结构”、“保持香港澳门长期繁荣稳定”等部分也列入了中医药内容。
陈竺说，各地要认真总结发挥中医药作用的好做法、好经验，并吸收到未来医改政策中，在确定医改工作任务时，要时刻想到如何利用好中医药资源，不能让中医药边缘化。
他同时也要求，中医药管理部门要提前谋划，提出切实可行的方案，把中医药更好地融入到医改大局中，真正使中医药发挥应有的作用。