维生素饮料中添加的维生素大都是人工合成的，有的结构和天然的一样，有的不一样。水果中的维生素是天然的，除了维生素、矿物质和膳食纤维外，还含有有益健康的植物化合物，如类黄酮、花青素等，这是饮料所不能提供的。另外，水果中含有维生素的同时，还含有其他营养素，可以发挥协同作用促进其他营养素的吸收利用。维生素饮料是不能代替水果的。
长期把维生素饮料当水喝，对健康来说弊大于利。大多饮料都含有添加进去的糖，含有较多的能量。例如，某种维生素C饮料，200毫升含能量约76千卡，按照正常人每天至少喝水1200毫升计算，与白开水相比，就会多摄入450千卡左右能量，这些能量如果不能通过运动得到消耗，就会转成脂肪储存体内，长时间下去就有可能引起超重或肥胖。
维生素饮料中所含的营养素单一，比不少水果或蔬菜中的营养素素和有益健康的成分。经常喝含糖多的维生素饮料，会影响食欲，影响一日三餐，出现微量营养素摄入不足的问题。
