．未养成按时排便的习惯
宝宝约三岁左右，大脑就会意识到肠子蠕动且知道即将要排便的感觉，有些宝宝就会告诉大人—我要上厕所。不过这个时期，也是宝宝对外界最好奇的阶段，因此，宝宝常常因为玩过头，或将注意力专注在某个事物上而错过排便的时机。至于，处在婴儿阶段的宝宝，由于还不会控制排便，所以往往得在两岁左右，才能慢慢养成排便习惯。
因此，养成宝宝良好的排便习惯，那么可以从宝宝两岁左右开始；如果爸爸、妈妈没有帮宝宝养成好的排便习惯，宝宝未来将很容易引起便秘的问题。
．食物摄取不均衡
宝宝食量太少或食用过多高脂肪、高蛋白质的食物，如肉类、蛋类、油炸食品等，和水分与蔬果摄取不足时，使得消化吸收后残渣少，对肠道不能刺激引发排便反射，也容易有便秘的问题。
．心理上的压力及缺乏运动
缺少运动、情绪不安、或突然受到精神上的刺激，如：大人们过度焦虑而强制宝宝训练排便等也会抑制胃肠蠕动，而导致肠壁肌肉乏力进而造成便秘的问题。
．先天性或是肠胃道异物阻塞等疾病
宝宝一出生时就有大肠结构异常，如：狭窄、先天性肠缺乏神经（巨结肠症）等疾病时，也会引起肠道功能障碍，造成肠壁肌肉张力减低，肠蠕动减慢，而导致便秘。
或是宝宝罹患有内分泌或代谢上的异常，如：甲状腺机能低下；或是神经肌肉疾病，如：脊柱裂、脊髓发育不良等。或是肠胃道异物阻塞，如：肿瘤等也都会导致宝宝便秘的问题。
．服用药物
许多药物会抑制大肠蠕动，引起便秘，常见的药物，如：止咳药等。或不当的灌肠、服用泻药，这些都会使得肠道的敏感度减弱，加重便秘的困扰。
．其它
宝宝肛门周围的皮肤因为尿布疹，或其它因素导致发炎、肛门裂伤，也会引起排便疼痛的问题，敏感的宝宝甚至会恐惧排便，而拖延排便时间。
