每种疗法都有它的适应范围，针灸也不例外。中国中医科学院养生保健研究中心教授窦思东说，中医针灸只是医疗体系中的一种疗法，一样有严格的适应症和禁忌症，“目前中医针灸的适应症有300多种，其中对各种疼痛有很好的疗效。”
风湿性关节炎 风湿性关节炎致残率很高，严重影响患者的工作和生活，也被称为“不死的癌症”。中医认为风湿性关节炎的致病机理为机体感受风、寒、湿邪入侵，以致脉络闭阻、气滞血淤、经脉阻滞，日久筋骨失却濡养，不通则痛。通过针灸治疗有显效(疼痛及其他症状明显减轻，关节活动度显著好转，局部压痛基本消失)的患者能达半数以上。
颈肩腰腿疼痛 现代社会的一种常见多发病症，致病原因复杂，症状表现多样，治疗耗时长，疗效也不确定。在非手术疗法中，针灸显示出了很大的优越性。针灸治疗通过对不同类型的颈肩腰腿疼痛疾病，分别采取针刺、艾灸、刺络放血拔罐、埋线等不同治疗手段或综合治疗，能有效疏通经络，调理气血，达到治愈疾病的目的。
痛经 痛经给不少女性的工作和生活带来了很大困扰。相对于西医来说，中医针灸对于痛经的治疗更偏重于调理。通过针刺相关的穴位，调整女性体内的激素水平，从而达到缓解疼痛，调整经期的效果。
神经系统麻痹、萎缩 这类疾病范围很广，常见的有面部神经麻痹等，西医治疗效果不明显，而中医针灸有其独特优势，在急性期和恢复期都可采用针灸和拔罐配合的方法进行治疗。
运动型损伤 目前西医对运动系统损伤多采用封闭治疗，虽然能在短时间内止痛，但对于运动器官的损伤也非常大，很多运动员在退役之后身体机能都会受到很大伤害。而针灸治疗运动型损伤不需要注射药物，对于缓解肿胀、血肿和运动障碍都有很好的效果。
失眠、焦虑及抑郁 失眠、焦虑和抑郁等神经系统疾病通常采用药物治疗，但患者易对药物形成依赖。目前国外对失眠、焦虑和抑郁等心理方面的疾病也使用针灸进行调理和治疗，但国内还没认识到中医对神经系统疾病的疗效。
肿瘤后期康复 肿瘤后期的康复也可以使用针灸来缓解疼痛。另外，对于化疗后的免疫力下降，也可以通过艾灸的方法来进行调理。
禁忌区
窦思东表示，很多人将中医针灸吹得神乎其神，而“一针包 治百病”的说法在民间也有很多人相信。实际上某些疾病或某些情况下是不能使用针灸治疗的，“目前在正规的中医医院里都能进行常规检查，排除中医针灸的禁忌症，才能进行针灸治疗。可以说中医针灸正在走出经验论的范围，向着更科学的方向发展。”
一些感染性疾病：如果很严重的话，不能在感染部位做针灸，如膝关节有炎症，就不能在膝关节附近扎针。如果局部有囊肿，也不能在附近进行针灸，需要排除肿瘤的可能性，防止肿瘤细胞扩散。
一些出血性疾病：如血友病患者，不能进行针灸治疗。
病因不明的疾病：也不能轻易用针，需要找出病因才能进行针灸治疗。亚健康调理：首先应排除患有其他疾病的可能性，再进行针灸的理疗。
