8月9日下午，卫生部部长陈竺在甘肃舟曲灾区与卫生部首批援助灾区专家组举行了简短的座谈会。陈竺强调，救治生命仍是当前最要紧的事情，只要有一丝希望，就要做百分之百的努力。医疗卫生工作要实现3个全覆盖，即医疗救治全覆盖、卫生防疫全覆盖、水和食品安全监督全覆盖。
在医疗救治方面，陈竺表示，在黄金72小时内，依然要将救治生命作为最要紧的事情，只要有一丝希望，就要做百分之百的努力。此外，考虑目前灾区的治疗条件有限，灾区收治的轻重伤员都将转运至兰州接受进一步治疗。
目前，灾区已有舟曲县人民医院和武警建立的野战医院两个医疗救治平台，各居民安置点也陆续开设医疗救治点。对此，陈竺要求，医疗点需要整合统一指挥，对医疗资源进行合理配置，保障灾区居民的日常医疗需求。
在卫生防疫方面，陈竺要求，灾区清淤工作进行到哪里，卫生防疫消杀工作就要跟进到哪里。目前，进入灾区的防疫队伍已经超过100人，要确保防疫工作到位，保障每个安置点既有医疗队，也有防疫队。已经进入灾区的国家专家组，应尽快对灾区防疫情况进行评估。同时，应尽快恢复灾区的疫情报告体系，重视粪便、垃圾的处理，预防肠道传染病及其他疫病的传播。
水的消毒、食品安全的保障同样是灾区百姓卫生安全的大事。陈竺强调，要加强对灾区居民的健康宣教，指导饮用水消毒，并加强对灾区捐赠食品安全的监管。
8月8日晚，卫生部派出由北京协和医院、朝阳医院、积水潭医院、胸科医院、天坛医院、回龙观医院等多家北京三甲医院及中国疾病预防控制中心抽调的专家连夜赶赴灾区，指导医疗卫生工作。记者了解到，随后，卫生部仍将派出疾控、卫生监督等专家前往灾区。
据悉，此前卫生部已经在舟曲成立医疗卫生工作组，组长由陈竺担任，下设医疗救治、防疫消杀、联络和救援物资募集4个小组。其中，医疗救治组负责重症伤员医疗救治、医疗点管理、血液供应和保障、医疗救援急救车调配等；防疫消杀组负责对遇难者遗体进行无害化处理、清淤消毒、心理干预、生活饮用水消毒和食品安全工作；联络组负责物资调运、伤员转运的协调工作；救援物资募集组负责救援物资的募集、运送工作。
另据悉，四川、陕西各有1支20人的消杀队伍，卫生部1支13人组成的专家组，青海果乐1支10人组成的救援队，兰州军区兰州总医院1支90人的医疗队正在赶赴灾区。