阴茎短小，小睾丸应针对不同的病因用药。
例如，下丘脑有病变，垂体功能正常者，应使用促黄体释放激素，若脑垂体有病变，睾丸功能正常者，应使用绒毛膜促性腺激素;只有当睾丸有问题时，才可使用睾丸酮。若不分青红皂白，一概都用睾丸酮，其结果并不理想，就是这个道理。
不同人群的“阴茎改造”方法：
1，体形肥胖的人，由于身体下腹部的脂肪层比较厚，造成阴茎被埋入脂肪层，形成“乌龟头式阴茎”。这种情况下用脂肪抽取机除去下腹部的脂肪层或手术切除脂肪层后，在外观上就有阴茎长度延长的效果。
2，单纯脂肪注射阴茎成形术：这种手术方法是抽取自身的脂肪，注射入阴茎内。优点是手术简单，创伤少。缺点是注射脂肪的存活与否这一关健问题受较多因素制约，手术效果也不尽理想。医学界对此方法有不同看法，仍然处于探索阶段，提高脂肪移植后存活率是关健。
3，假体植入：假体植入本来是欧美国家治疗器质性阳痿的一种手术方法。植入假体后，阴茎也可以增长、增粗。因此，在一些有强烈增大增粗阴茎愿望的患者的要求下，欧美国家有时也使用这一方法满足他们的要求。此类手术在国内目前还很少开展。
小阴茎治疗方法有一定改进。但是，雄激素的替代仍然是主要的治疗方法。由于给患者体内提供了足够的睾酮，将刺激阴茎的发育，并不影响骨髂的生长和闭合。Aller推荐的治疗方法为每3周口服睾酮25mg，总量不超过100mg。应通过治疗前、后的阴茎长度测量(耻骨至龟头)评价治疗效果。应从一岁开始治疗。目的是使患儿生殖器官发育与身体增长保持一致。如患儿阴茎生长比较同龄儿童差，应重复上述治疗。对伴有睾丸下降不全的患儿，应在2岁前行睾丸下降固定术。亦可应用LHRH，促进阴茎的发育和睾丸下降。
“阴茎悬韧带切除术”和“阴茎带蒂皮瓣移植术”被认为是目前为止较为满意的阴茎重建方法。
一、阴茎悬韧带切除术
这项手术的原理是：从人的体表外观看到的阴茎只是阴茎的一部分，阴茎的另一部分隐藏在耻骨下面的组织内，由阴茎悬韧带固定。当切除阴茎悬韧带后，让这一部分的阴茎也外露出来，从而延长阴茎。资料显示，在治疗阴茎发育不良症者1347例病案中，84%的患者阴茎可延长3至5厘米。国内外医学界普遍认为，这种手术操作安全，病人痛苦少，费用不高，便于推广应用，在重建阴茎这一技术领域中，是目前最好的方法。
二、阴茎带蒂皮瓣移植术 阴茎带蒂皮瓣移植术又叫自体真皮脂肪瓣移植术，是增粗阴茎的有效方法。阴茎带蒂皮瓣移植术最先在国外开展，近年推广到国内。
阴茎带蒂皮瓣移植术增粗阴茎的方法是：用取自自身的皮肤组织，去除表皮，保留真皮和脂肪，移植到阴茎上，增粗阴茎。为保证移植成功，手术要分步进行：先从自体供区(腹股沟或臀部或大腿根部)取皮肤，制作带蒂皮瓣。“带蒂”的意思是指并不完全切除皮肤，而是保留部分内含有血管供应的“蒂”，保证皮瓣的成活，制成“带蒂皮瓣”确定“带蒂皮瓣”成功准备、存活后，进入第二步。切除表皮，保留真皮和脂肪，移植到阴茎上。此时仍然需要保留含有血管供应的“蒂”，直到确认移植组织成功在阴茎形成新的血管供应，移植组织成功存活，不再需要“蒂”提供血管供应后才能切除“蒂”，完成整个手术。
这个手术的优点是：能够保证较高的移植成功率，保证较可靠的增粗效果。
